北京大学医学部のパートナーシップは世界中に広がっています。

医学教育の国際化の需要は日々高まり、医学部の海外交流もますます盛んになっています。そのため北京大学医学部は、医学部生の国際的視野を広げ、総合的素養を高めようと毎年、海外交流プログラムを実施しています。1980 年以降、北米、ヨーロッパ、アジア、オセアニアなどの80 以上の大学と医学教育、科学研究、医療サービス、マネジメントにおいて情報交換や提携プログラムが構築されてきました。さらに世界保健機関（WHO）、China Medical Board（CMB）、アメリカ国立衛生研究所（NIH）、アメリカ疫病予防管理センター（CDC）、プロジェクトHOPE などの数々の非政府組織（NGO）と良好な協力関係を築いています。